澳洲有很多大学开设环境工程硕士，包括五星级大学和四星级大学。但每个学校的课程设置不太相同，但基本上来说都是两年制课程设置，并且一般来说课程中会有半年的Project或是Thesis要完成。并且在课程设置上一般都会有三门或三门以上的环境工程管理类课程。澳大利亚开设环境工程专业的学校代表有新南威尔士大学、悉尼科技大学、墨尔本大学等。
新南威尔士大学工程科学（环境工程）专业
新南威尔士的大学工程科学硕士专业为工程师和毕业生提供了扩展专业知识和职业技能的机会；本专业的学生将获得专业的认可，还有和前沿行业的学科交流学习的机会；本专业将培养学生的职业技术和分析工程问题的能力，从而进一步提高工程问题解决和做决策的能力；学校会学生提供复杂的，开放式的研究项目，这将系统的提高学生在工程问题以及项目中的阐释，分析以及沟通的能力。
新南威尔士大学工程科学（环境工程）专业课程
设计实践A、业务和项目、工程合同、可持续性建筑、岩石边坡工程、环境地质力学、变形监测调查、环境工程科学1、环境工程科学2、环境管理、可持续和风险分析、研究生项目A、研究生项目B、工程硕士研究技能、工程经济和金融管理、项目管理框架等
悉尼科技大学环境工程专业
悉尼科技大学环境工程延展硕士为本科工程毕业生提供了学习并拓展本科工程的专业知识和技能的机会；本专业学生可以主修一个环境工程专业方向，并辅修另外一个工程专业方向，计算机或者其他领域专业；本专业为学生提供强制性的工程学科专业实践，主修和辅修相关课程，本专业学生必须完成至少一个工程学科的研究项目。
悉尼科技大学环境工程专业课程
先进项目管理、判断和决策、工程风险管理、系统工程经理、应用财务管理、经济评价、领导和责任、质量规划和分析、工程价值链系统、项目方向课程、环境工程核心课程、环境工程选修课程、生物医学工程、土木工程、计算机控制工程等
墨尔本大学环境工程专业
环境工程师能够创建可持续解决环境问题的方法；本专业学生将从行业导师那里学到能源，水力和废物管理的专业知识；学生将受益于与专业人士的沟通；他们将为学生分享世界各地环境工程项目的专业知识；这些项目的国家包括中国，越南、泰国、尼泊尔、斯里兰卡和印度；本专业客座讲师和研讨会都是来自社区项目、社会技术会议和网站访问等行业的专业人士；本专业旨在培养学生成为专业的环境工程师。
墨尔本大学环境工程专业课程
工程力学、工程数学、工程实践和沟通、流体力学、地球工程流程、工程材料、系统建模和设计、定量环境建模、可持续的基础设施工程、工程地点描述、工程项目实施、民用液压、环境分析工具、监测环境影响、综合设计，基础设施、综合设计--民事、可持续水资源系统、岩土工程、建筑工程等
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